Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rsf1E9PWW9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rsf1E9PWW9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms