Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trappc8E9PWG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc8E9PWG2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms