Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm6904E9PVF1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms