Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clca3bE9PUL3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms