Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Catsperg2C6KI89 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms