Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmf1B9EKI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmf1B9EKI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms