Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clip3B9EHT4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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