Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6133B2RY53 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6133B2RY53 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms