Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp26c1B2RXA7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms