Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprbB2RU80 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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