Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfc3h1B2RT41 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms