Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Col4a6B1AVK5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a6B1AVK5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms