Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Grik3B1AS29 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grik3B1AS29 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms