Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4930435E12RikA6X8Z9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
4930435E12RikA6X8Z9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms