Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbp4A4UUI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms