Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms