Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prdm12A2AJ77 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prdm12A2AJ77 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms