Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Frmpd4A2AFR3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms