Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pramef6A2A8M8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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