Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fbf1A2A870 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms