Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Calcoco2A2A6M5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms