Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

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Length 543 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm27029A2A4P4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm27029A2A4P4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm27029A2A4P4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms