Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1bA1Z198 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp1bA1Z198 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms