Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TomtA1Y9I9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TomtA1Y9I9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms