Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PclafQ9CQX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PclafQ9CQX4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PclafQ9CQX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PclafQ9CQX4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms