Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed6Q9CQG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmed6Q9CQG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmed6Q9CQG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms