Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GatbQ99JT1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GatbQ99JT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GatbQ99JT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GatbQ99JT1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GatbQ99JT1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GatbQ99JT1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GatbQ99JT1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms