Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan1Q99J59 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan1Q99J59 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan1Q99J59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan1Q99J59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms