Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRELD1Q96HD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CRELD1Q96HD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRELD1Q96HD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms