Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
CastP51125 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
CastP51125 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
CastP51125 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
CastP51125 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
CastP51125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
CastP51125 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
CastP51125 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
CastP51125 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
CastP51125 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
CastP51125 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29,18■■■□□ 2,26
CastP51125 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
CastP51125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
CastP51125 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
CastP51125 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
CastP51125 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
CastP51125 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
CastP51125 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
CastP51125 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
CastP51125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
CastP51125 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
CastP51125 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
CastP51125 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
CastP51125 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
CastP51125 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
CastP51125 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29,14■■■□□ 2,26
CastP51125 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
CastP51125 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
CastP51125 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,13■■■□□ 2,25
CastP51125 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
CastP51125 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,12■■■□□ 2,25
CastP51125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
CastP51125 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,11■■■□□ 2,25
CastP51125 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
CastP51125 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
CastP51125 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
CastP51125 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
CastP51125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
CastP51125 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
CastP51125 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
CastP51125 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,07■■■□□ 2,24
CastP51125 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
CastP51125 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
CastP51125 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
CastP51125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29,06■■■□□ 2,24
CastP51125 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
CastP51125 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
CastP51125 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
CastP51125 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29,05■■■□□ 2,24
CastP51125 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
CastP51125 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
CastP51125 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29,04■■■□□ 2,24
CastP51125 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29,03■■■□□ 2,24
CastP51125 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
CastP51125 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
CastP51125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
CastP51125 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
CastP51125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
CastP51125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
CastP51125 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
CastP51125 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
CastP51125 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
CastP51125 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
CastP51125 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
CastP51125 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
CastP51125 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
CastP51125 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
CastP51125 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
CastP51125 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
CastP51125 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
CastP51125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
CastP51125 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
CastP51125 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28,97■■■□□ 2,23
CastP51125 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
CastP51125 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
CastP51125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
CastP51125 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
CastP51125 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
CastP51125 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28,95■■■□□ 2,23
CastP51125 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
CastP51125 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
CastP51125 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
CastP51125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
CastP51125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
CastP51125 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
CastP51125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
CastP51125 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
CastP51125 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
CastP51125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
CastP51125 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,4 ms