Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XlrP05531 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XlrP05531 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XlrP05531 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XlrP05531 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XlrP05531 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XlrP05531 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XlrP05531 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XlrP05531 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XlrP05531 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XlrP05531 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XlrP05531 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XlrP05531 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XlrP05531 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XlrP05531 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XlrP05531 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XlrP05531 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
XlrP05531 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
XlrP05531 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XlrP05531 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XlrP05531 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
XlrP05531 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
XlrP05531 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XlrP05531 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
XlrP05531 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XlrP05531 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
XlrP05531 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XlrP05531 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
XlrP05531 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
XlrP05531 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XlrP05531 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XlrP05531 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XlrP05531 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
XlrP05531 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XlrP05531 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XlrP05531 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XlrP05531 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XlrP05531 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XlrP05531 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XlrP05531 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XlrP05531 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XlrP05531 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XlrP05531 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XlrP05531 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XlrP05531 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XlrP05531 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XlrP05531 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XlrP05531 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XlrP05531 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XlrP05531 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XlrP05531 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XlrP05531 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XlrP05531 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XlrP05531 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XlrP05531 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XlrP05531 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XlrP05531 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XlrP05531 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XlrP05531 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XlrP05531 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XlrP05531 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XlrP05531 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XlrP05531 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XlrP05531 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XlrP05531 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XlrP05531 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XlrP05531 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XlrP05531 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XlrP05531 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XlrP05531 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XlrP05531 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XlrP05531 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms