Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20517G3UVU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20517G3UVU6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20517G3UVU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms