Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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