Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Knop1Q9Z2Q2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Knop1Q9Z2Q2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms