Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccne2Q9Z238 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccne2Q9Z238 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms