Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms