Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn9Q9Z0S7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn9Q9Z0S7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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