Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gbp2Q9Z0E6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms