Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pacsin2Q9WVE8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms