Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnni1Q9WUZ5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms