Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnip1Q9WUU8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms