Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Scnn1bQ9WU38 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Scnn1bQ9WU38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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