Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Psma1Q9R1P4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms