Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AmfrQ9R049 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AmfrQ9R049 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms