Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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VapbQ9QY76 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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