Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxnb3Q9QY40 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms