Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkp3Q9QY23 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms