Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr2e3Q9QXZ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2e3Q9QXZ7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms