Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cyth1Q9QX11 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cyth1Q9QX11 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms