Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cyp39a1Q9JKJ9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms